多层次的司法体系是知识产权的最主要保护手段。在通常情况下，美国联邦地区法院是知识产权侵权案件的初审管辖法院。纠纷案件分为两种情形：专利纠纷一般在联邦巡回法院审理，上诉则由联邦高级法院上诉法庭审理。联邦巡回法院的介入，减少了审理前的司法管辖权冲突，使专利制度更加稳定；其他纠纷，如州注册商标和按习惯法取得的商标侵权案及商业秘密的滥用、不正当竞争等案件一般由州法院审理。如果原告或被告不服州法院的判决，可向联邦巡回法院提出上诉，联邦巡回法院的判决为终审判决。除司法保护，美国还利用行政程序和仲裁制度保护知识产权。
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